Als behandelaar zoekt u de beste behandeling voor uw patiënten. Het genetisch profiel kan een zinvolle aanvulling zijn op de tumor typering, gradering en stadiering. Met Next Generation Sequencing sporen we relevante mutaties op. Bezit een tumor een mutatie met een grote therapierespons dan kan de patiënt baat hebben bij een therapie. Deze kennis vermindert ook het aantal ineffectieve behandelingen, en voorkomt daarmee onnodige toxiciteit en kosten voor de patiënt.

Voordelen van Next Generation Sequencing 

  • Mutatie status van alle relevante genen wordt bepaald in één enkel experiment
  • Zeer beperkte hoeveelheid weefsel is voldoende
  • Relatief lage kosten
  • Gestreefd wordt naar een uitslag van alle genen binnen 1 week na aanvraag

Techniek 

Voor het uitvoeren van Next Generation Sequencing beschikken we over:

  • Ion Torrent: een pH-gemedieerde next-generation sequencer waarbij de basevolgorde wordt afgelezen op basis van een pH verandering na het inbouwen van een specifieke nucleotide.
  • Ion Chef: robot voor het gestandaardiseerd prepareren van patiëntmateriaal en opbrengen op de libaries op de sequencing chip. Hiermee verminderen het aantal handmatige stappen en mogelijke (menselijke) fouten.
  • Sequencing chips: Chips waarop miljoenen sequentie reacties in parallel kunnen worden uitgevoerd. Hierdoor is het mogelijk om binnen enkele uren alle relevante genen te kunnen meten.
  • Ion Reporter: Gestandaardiseerde analyse software die specifiek is ontworpen voor de Ion Torrent technologie.
  • Laboratorium: CCKL/ISO geaccrediteerd moleculair laboratorium

De sleutel voor doelgerichte therapie 

Bij Pathologie-DNA kunnen verschillende standaard genenpanels worden aangevraagd om een optimale diagnose te krijgen voor doelgerichte therapie en differentiaal diagnose. Naast standaard geïndiceerde genen (zie overzicht hieronder) bestaat er de mogelijkheid om mutaties in additionele genen te bepalen die wellicht in de nabije toekomst belangrijk worden en momenteel getest worden in klinische studies.

Targeted therapie 

Longcarcinoom: KRAS, EGFR, BRAF, ERBB2, MEKI, PIK3CA, ALK

Colorectaal carcinoom: KRAS, NRAS, BRAF, PIK3CA

Melanoom: BRAF, NRAS, KIT

Gastro-intestinale stroma tumoren: KIT, PDGFRA, BRAF

Mammacarcinoom: ERBB2, PIK3CA

Schildkliercarcinoom: BRAF, KRAS, NRAS, HRAS

Differentiaal diagnostiek 

Verwantschap meerdere tumoren (vraagstelling 2e primaire tumor of uitzaaiing): TP53, CDKN2A + gehele Cancer Hotspot Panel (50 genen).

Papillair schildklier carcinoom: BRAF

Laaggradig glioom: IDH1, IDH2

Uveal melanoom en Spitzoid naevus: BRAF, NRAS, HRAS, KIT, GNAQ, GNA11.

Desmoid tumor: CTNNB1

Langerhans cell histiocytose: BRAF

Hairy cell leukemie: BRAF

Nieuwe ontwikkelingen 

Op dit moment werken we bij Pathologie-DNA aan:

  • Centralisatie van moleculaire technieken en kennis ter vergroting van kwaliteit en efficiëntie
  • Up-to-date blijven om qua diagnostiek direct te kunnen inspelen op nieuw mutaties of doelgerichte middelen.
  • Uitbreiding van het NGS-portfolio voor een nog completere moleculaire diagnose.
    • Detectie van translocaties en fusiegenen
    • Analyse van copy number variaties (amplifictie en deleties)
    • Ontwikkeling specifiek panel voor lymfoomdiagnostiek
    • B- en T-cel clonaliteits bepaling (momenteel nog m.b.v. fragment analyse).

Referentie 

Specifieke wensen? 

Overleg met onze moleculair biologen over eventuele andere genen die wellicht bepaald kunnen worden voor specifieke vraagstellingen.

Mail ons via: moleculair@pathologie-dna.nl